Balík: r-cran-spp (1.16.0-2 a iné)

[ Zdroj: r-cran-spp  ]

GNU R ChIP-seq processing pipeline

R package for anlaysis of ChIP-seq and other functional sequencing data

 * Assess overall DNA-binding signals in the data and select appropriate
   quality of tag alignment.
 * Discard or restrict positions with abnormally high number of tags.
 * Calculate genome-wide profiles of smoothed tag density and save them
   in WIG files for viewing in other browsers.
 * Calculate genome-wide profiles providing conservative statistical
   estimates of fold enrichment ratios along the genome. These can be
   exported for browser viewing, or thresholded to determine regions of
   significant enrichment/depletion.
 * Determine statistically significant point binding positions
 * Assess whether the set of point binding positions detected at a
   current sequencing depth meets saturation criteria, and if does not,
   estimate what sequencing depth would be required to do so.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom r-cran-spp

• dep: libbz2-1.0

  kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [amd64, hppa, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie alpha, hppa, ia64, riscv64, sh4, sparc64]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [sparc64]

  Balík nie je dostupný

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, loong64, riscv64]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [nie arm64, loong64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

• dep: r-api-3.5 [sparc64]

  Balík nie je dostupný

• dep: r-api-4.0 [nie sparc64]

  virtuálny balík poskytovaný balíkom r-base-core

• dep: r-base-core (>= 3.5.1-1) [sparc64]

  jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

  dep: r-base-core (>= 4.0.2-1) [nie arm64, loong64, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: r-base-core (>= 4.1.1-2) [sh4]

• dep: r-bioc-rsamtools

  GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import

• dep: r-cran-bh (>= 1.66) [nie sparc64]

  (Virtual) GNU R package to provide BH

• dep: r-cran-catools

  GNU R package providing various utility functions

• dep: r-cran-rcpp

  balík GNU R na hladkú integráciu R a C++

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť r-cran-spp

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.16.0-2	316.0 kB	473.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.16.0-2	315.3 kB	453.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.16.0-2+b1	315.1 kB	436.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	1.16.0-2	320.3 kB	461.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.16.0-2	332.4 kB	597.0 kB	[zoznam súborov]
loong64 (neoficiálny port)	1.16.0-2	308.4 kB	432.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.16.0-2	308.7 kB	452.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.16.0-2	316.9 kB	499.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.16.0-2	317.2 kB	497.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.16.0-2+b1	312.3 kB	401.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.16.0-2	311.0 kB	444.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.16.0-2	332.8 kB	439.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.15.5-1	307.6 kB	431.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	1.16.0-2	316.0 kB	441.0 kB	[zoznam súborov]