Balík: clustalx (2.1+lgpl-9 a iné)

[ Zdroj: clustalx  ]

balík na viacnásobné zarovnávanie sekvencií nukleových kyselín a bielkovín - grafické rozhranie

Tento balík ponúka grafické používateľské rozhranie k programu Clustal Multiple Sequence Alignment (MSA). Poskytuje integrované prostredie na viacnásobné zarovnávanie sekvencií a profilov na analyzovanie výsledkov. Zarovnanie sekvencií sa zobrazuje v okne na obrazovke. Všestranná schéma farieb zvýrazňuje zachované rysy zarovnania. Na profesionálnu prezentáciu by ste mali použiť balíky LaTeXu texshade alebo boxshade.

Roletové menu v hornej časti okna vám umožňujú zvoliť všetky voľby potrebné pre tradičné viacnásobné zarovnávanie sekvencií a profilov . Môžete vkladať sekvencie, aby ste zmenili poradie zarovnania. Môžete vybrať podmnožinu sekvencií, ktoré chcete zarovnať. Môžete vybrať podrozsah zarovnania, ktorý chcete znovu zarovnať a vložiť späť do pôvodného zarovnania.

Môžete vykonať analýzu kvality zarovnania a zvýrazniť úseky s nízkym počtom bodov alebo výnimočné rezíduá.

Značky: Biológia: Clustal/ALN, Proteins, Pole: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementované v: implemented-in::c, interface::commandline, User Interface: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Scope: Utility, Sada nástrojov používateľského rozhrania: Lesstif/Motif, uitoolkit::qt, use::analysing, Purpose: Porovnávanie, use::viewing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag, X Window System: Aplikácia

Ostatné balíky súvisiace s balíkom clustalx

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [m68k]

  pomocná knižnica poskytujúca zabudované funkcie __atomic

• dep: libc6 (>= 2.29) [m68k]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, m68k, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgl1 [m68k, sparc64]

  knižnica dispečera GL nezávislá od dodávateľa - podpora spätnej kompatibility s GL

• dep: libqt5core5a (>= 5.7.0) [m68k]

  základný modul Qt 5

• dep: libqt5core5t64 (>= 5.15.1) [amd64, i386, x32]

  základný modul Qt 5

  dep: libqt5core5t64 (>= 5.7.0) [nie amd64, i386, m68k, x32]

• dep: libqt5gui5 (>= 5.2.0) [m68k]

  modul grafického používateľského rozhrania Qt 5

  alebo libqt5gui5-gles (>= 5.2.0)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5gui5t64 (>= 5.2.0) [nie m68k]

  modul grafického používateľského rozhrania Qt 5

  alebo libqt5gui5-gles (>= 5.2.0)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5widgets5 (>= 5.0.2) [m68k]

  modul ovládacích prvkov Qt 5

• dep: libqt5widgets5t64 (>= 5.0.2) [nie m68k]

  modul ovládacích prvkov Qt 5

• dep: libqt5xml5 (>= 5.0.2) [m68k]

  Qt 5 - XML modul

• dep: libqt5xml5t64 (>= 5.0.2) [nie m68k]

  Qt 5 - XML modul

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie m68k]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k]

• dep: libunwind8 [ia64]

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

• sug: boxshade

  Pretty-printing of multiple sequence alignments

• sug: clustalw

  globálne viacnásobné zarovnávanie sekvencií nukleotidov alebo peptidov

• sug: texlive-latex-extra

  TeX Live: LaTeX additional packages

Stiahnuť clustalx

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	2.1+lgpl-9+b1	405.8 kB	1,659.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	2.1+lgpl-9+b1	445.0 kB	1,427.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	2.1+lgpl-9+b1	385.0 kB	1,334.0 kB	[zoznam súborov]
armel	2.1+lgpl-9+b1	378.0 kB	1,262.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	2.1+lgpl-9+b1	390.7 kB	962.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	2.1+lgpl-9+b1	419.9 kB	1,461.0 kB	[zoznam súborov]
i386	2.1+lgpl-9+b1	474.3 kB	1,470.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	2.1+lgpl-9+b1	501.1 kB	2,574.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	2.1+lgpl-9	416.1 kB	1,369.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	2.1+lgpl-9+b1	395.1 kB	1,726.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	2.1+lgpl-9+b1	423.6 kB	1,782.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	2.1+lgpl-9+b1	428.8 kB	1,654.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	2.1+lgpl-9+b2	433.5 kB	1,130.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	2.1+lgpl-9+b1	446.3 kB	1,470.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	2.1+lgpl-9+b1	506.1 kB	1,336.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	2.1+lgpl-9+b1	356.6 kB	2,179.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	2.1+lgpl-9+b1	444.7 kB	1,342.0 kB	[zoznam súborov]