Balík: clustalx (2.1+lgpl-9)

[ Zdroj: clustalx  ]

balík na viacnásobné zarovnávanie sekvencií nukleových kyselín a bielkovín - grafické rozhranie

Tento balík ponúka grafické používateľské rozhranie k programu Clustal Multiple Sequence Alignment (MSA). Poskytuje integrované prostredie na viacnásobné zarovnávanie sekvencií a profilov na analyzovanie výsledkov. Zarovnanie sekvencií sa zobrazuje v okne na obrazovke. Všestranná schéma farieb zvýrazňuje zachované rysy zarovnania. Na profesionálnu prezentáciu by ste mali použiť balíky LaTeXu texshade alebo boxshade.

Roletové menu v hornej časti okna vám umožňujú zvoliť všetky voľby potrebné pre tradičné viacnásobné zarovnávanie sekvencií a profilov . Môžete vkladať sekvencie, aby ste zmenili poradie zarovnania. Môžete vybrať podmnožinu sekvencií, ktoré chcete zarovnať. Môžete vybrať podrozsah zarovnania, ktorý chcete znovu zarovnať a vložiť späť do pôvodného zarovnania.

Môžete vykonať analýzu kvality zarovnania a zvýrazniť úseky s nízkym počtom bodov alebo výnimočné rezíduá.

Značky: Biológia: Clustal/ALN, Proteins, Pole: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementované v: implemented-in::c, interface::commandline, User Interface: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Scope: Utility, Sada nástrojov používateľského rozhrania: Lesstif/Motif, uitoolkit::qt, use::analysing, Purpose: Porovnávanie, use::viewing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag, X Window System: Aplikácia

Ostatné balíky súvisiace s balíkom clustalx

• dep: libc6 (>= 2.29)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libqt5core5a (>= 5.15.1) [amd64, i386]

  základný modul Qt 5

  dep: libqt5core5a (>= 5.7.0) [nie amd64, i386]

• dep: libqt5gui5 (>= 5.2.0)

  modul grafického používateľského rozhrania Qt 5

  alebo libqt5gui5-gles (>= 5.2.0)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5widgets5 (>= 5.0.2)

  modul ovládacích prvkov Qt 5

• dep: libqt5xml5 (>= 5.0.2)

  Qt 5 - XML modul

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• sug: boxshade

  Pretty-printing of multiple sequence alignments

• sug: clustalw

  globálne viacnásobné zarovnávanie sekvencií nukleotidov alebo peptidov

• sug: texlive-latex-extra

  TeX Live: LaTeX additional packages

Stiahnuť clustalx

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	427.0 kB	1,342.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	369.7 kB	1,225.0 kB	[zoznam súborov]
armel	369.2 kB	1,209.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	384.9 kB	929.0 kB	[zoznam súborov]
i386	458.4 kB	1,389.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	385.7 kB	1,617.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	387.6 kB	1,556.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	418.9 kB	1,529.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	377.9 kB	1,353.0 kB	[zoznam súborov]