パッケージ: clustalx (2.1+lgpl-9 など)

[ ソース: clustalx  ]

Multiple alignment of nucleic acid and protein sequences (graphical interface)

This package offers a GUI interface for the Clustal multiple sequence alignment program. It provides an integrated environment for performing multiple sequence- and profile-alignments to analyse the results. The sequence alignment is displayed in a window on the screen. A versatile coloring scheme has been incorporated to highlight conserved features in the alignment. For professional presentations, one should use the texshade LaTeX package or boxshade.

The pull-down menus at the top of the window allow you to select all the options required for traditional multiple sequence and profile alignment. You can cut-and-paste sequences to change the order of the alignment; you can select a subset of sequences to be aligned; you can select a sub-range of the alignment to be realigned and inserted back into the original alignment.

An alignment quality analysis can be performed and low-scoring segments or exceptional residues can be highlighted.

タグ: 生物学: Clustal/ALN, タンパク質, 分野: field::biology, field::biology:bioinformatics, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, ユーザインタフェース: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, 対象範囲: ユーティリティ, インタフェースツールキット: Lesstif/Motif, uitoolkit::qt, use::analysing, 目的: 比較, use::viewing, works-with-format::plaintext, 取り扱い対象: 追加のタグが必要, X ウィンドウシステム: アプリケーション

その他の clustalx 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, arm64, ia64, m68k, sh4, x32 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64, m68k, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgl1 [sparc64]

  ベンダー中立な GL ディスパッチライブラリ -- 旧式 GL サポート

• dep: libqt5core5t64 (>= 5.15.1) [amd64, i386, x32]

  Qt 5 コアモジュール

  dep: libqt5core5t64 (>= 5.7.0) [amd64, i386, x32 以外]

• dep: libqt5gui5t64 (>= 5.2.0)

  Qt 5 GUI モジュール

  または libqt5gui5-gles (>= 5.2.0)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5widgets5t64 (>= 5.0.2)

  Qt 5 ウィジェットモジュール

• dep: libqt5xml5t64 (>= 5.0.2)

  Qt 5 XML モジュール

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64 以外]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• sug: boxshade

  多重配列アライメントのプリティプリンティング

• sug: clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

• sug: texlive-latex-extra

  TeX Live: LaTeX additional packages

clustalx のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	2.1+lgpl-9+b1	405.8 kB	1,659.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	2.1+lgpl-9+b1	445.0 kB	1,427.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	2.1+lgpl-9+b2	393.4 kB	1,398.0 kB	[ファイル一覧]
armel	2.1+lgpl-9+b1	378.0 kB	1,262.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	2.1+lgpl-9+b1	390.7 kB	962.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	2.1+lgpl-9+b1	419.9 kB	1,461.0 kB	[ファイル一覧]
i386	2.1+lgpl-9+b1	474.3 kB	1,470.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	2.1+lgpl-9+b1	501.1 kB	2,574.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	2.1+lgpl-9+b1	424.5 kB	1,430.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	2.1+lgpl-9+b1	395.1 kB	1,726.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	2.1+lgpl-9+b1	423.6 kB	1,782.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	2.1+lgpl-9+b1	428.8 kB	1,654.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	2.1+lgpl-9+b2	433.5 kB	1,130.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	2.1+lgpl-9+b1	446.3 kB	1,470.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	2.1+lgpl-9+b1	506.1 kB	1,336.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	2.1+lgpl-9+b1	356.6 kB	2,179.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	2.1+lgpl-9+b1	444.7 kB	1,342.0 kB	[ファイル一覧]