Paket: clustalx (2.1+lgpl-9 und andere)
Links für clustalx
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket clustalx herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Steffen Moeller (QS-Seite)
- Charles Plessy (QS-Seite)
- Andreas Tille (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [www.clustal.org]
Ähnliche Pakete:
Multiples Alignment von Nukleotid- und Proteinsequenzen (grafische Oberfläche)
Dieses Paket enthält eine grafische Oberfläche für Clustal, ein Programm für multiple Sequenzalignments. Das Paket enthält für die Analyse der Resultate eine integrierte Umgebung für multiple Sequenz- und Profilalignments. Das Sequenzalignment wird in einem Fenster angezeigt. Es wurde ein vielseitiges Farbschema implementiert, um konservierte Teile des Alignments hervorzuheben. Für professionelle Präsentationen ist das LaTeX-Paket texshade oder boxshade besser geeignet.
Sie können alle Optionen für herkömmliche multiple Sequenz- und Profilaligments über Pull-Down-Menüs am oberen Rand des Fensters erreichen. Sie können Sequenzen ausschneiden und einfügen, um die Alignment-Reihenfole zu ändern; Sie können eine Untermenge an Sequenzen auswählen, die verglichen werden sollen; Sie können einen Teilbereich des Alignments auswählen, neu anordnen und wieder in das ursprüngliche Alignment einfügen.
Es kann eine Qualitätsanlayse des Alignments durchgeführt werden. Außerdem können Segmente mit geringem Score oder ungewöhnlichen Resten hervorgehoben werden.
Andere Pakete mit Bezug zu clustalx
|
|
|
|
-
- dep: libatomic1 (>= 4.8) [m68k]
- Hilfsbibliothek, die atomare (__atomic) Built-in-Funktionen zur Verfügung stellt
-
- dep: libc6 (>= 2.29) [m68k]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, m68k, sh4, x32]
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.38) [x32]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]
- GCC Support-Bibliothek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC Support-Bibliothek
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC Support-Bibliothek
-
- dep: libgl1 [m68k, sparc64]
- Herstellerunabhängige GL-Verteilbibliothek -- Unterstützung für die alte libGL
-
- dep: libqt5core5a (>= 5.7.0) [m68k]
- Qt-5-Basismodul
-
- dep: libqt5core5t64 (>= 5.15.1) [amd64, i386, x32]
- Qt-5-Basismodul
- dep: libqt5core5t64 (>= 5.7.0) [nicht amd64, i386, m68k, x32]
-
- dep: libqt5gui5 (>= 5.2.0) [m68k]
- Qt-5-GUI-Modul
- oder libqt5gui5-gles (>= 5.2.0)
- Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant
-
- dep: libqt5gui5t64 (>= 5.2.0) [nicht m68k]
- Qt-5-GUI-Modul
- oder libqt5gui5-gles (>= 5.2.0)
- Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant
-
- dep: libqt5widgets5 (>= 5.0.2) [m68k]
- Qt-5-Widgetmodul
-
- dep: libqt5widgets5t64 (>= 5.0.2) [nicht m68k]
- Qt-5-Widgetmodul
-
- dep: libqt5xml5 (>= 5.0.2) [m68k]
- XML-Modul für Qt 5
-
- dep: libqt5xml5t64 (>= 5.0.2) [nicht m68k]
- XML-Modul für Qt 5
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nicht m68k]
- GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit
-
- sug: boxshade
- Pretty-printing von multiplen Sequenzalignments
-
- sug: clustalw
- Globale multiple Alignments von Nukleotid- oder Peptidsequenzen
-
- sug: texlive-latex-extra
- TeX Live: LaTeX additional packages
clustalx herunterladen
Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
---|---|---|---|---|
alpha (inoffizielle Portierung) | 2.1+lgpl-9+b1 | 405,8 kB | 1.659,0 kB | [Liste der Dateien] |
amd64 | 2.1+lgpl-9+b1 | 445,0 kB | 1.427,0 kB | [Liste der Dateien] |
arm64 | 2.1+lgpl-9+b1 | 385,0 kB | 1.334,0 kB | [Liste der Dateien] |
armel | 2.1+lgpl-9+b1 | 378,0 kB | 1.262,0 kB | [Liste der Dateien] |
armhf | 2.1+lgpl-9+b1 | 390,7 kB | 962,0 kB | [Liste der Dateien] |
hppa (inoffizielle Portierung) | 2.1+lgpl-9+b1 | 419,9 kB | 1.461,0 kB | [Liste der Dateien] |
i386 | 2.1+lgpl-9+b1 | 474,3 kB | 1.470,0 kB | [Liste der Dateien] |
ia64 (inoffizielle Portierung) | 2.1+lgpl-9+b1 | 501,1 kB | 2.574,0 kB | [Liste der Dateien] |
m68k (inoffizielle Portierung) | 2.1+lgpl-9 | 416,1 kB | 1.369,0 kB | [Liste der Dateien] |
mips64el | 2.1+lgpl-9+b1 | 395,1 kB | 1.726,0 kB | [Liste der Dateien] |
ppc64 (inoffizielle Portierung) | 2.1+lgpl-9+b1 | 423,6 kB | 1.782,0 kB | [Liste der Dateien] |
ppc64el | 2.1+lgpl-9+b1 | 428,8 kB | 1.654,0 kB | [Liste der Dateien] |
riscv64 | 2.1+lgpl-9+b2 | 433,5 kB | 1.130,0 kB | [Liste der Dateien] |
s390x | 2.1+lgpl-9+b1 | 446,3 kB | 1.470,0 kB | [Liste der Dateien] |
sh4 (inoffizielle Portierung) | 2.1+lgpl-9+b1 | 506,1 kB | 1.336,0 kB | [Liste der Dateien] |
sparc64 (inoffizielle Portierung) | 2.1+lgpl-9+b1 | 356,6 kB | 2.179,0 kB | [Liste der Dateien] |
x32 (inoffizielle Portierung) | 2.1+lgpl-9+b1 | 444,7 kB | 1.342,0 kB | [Liste der Dateien] |