Пакет: clustalx (2.1+lgpl-9 и другие)

[ Источник: clustalx  ]

Multiple alignment of nucleic acid and protein sequences (graphical interface)

This package offers a GUI interface for the Clustal multiple sequence alignment program. It provides an integrated environment for performing multiple sequence- and profile-alignments to analyse the results. The sequence alignment is displayed in a window on the screen. A versatile coloring scheme has been incorporated to highlight conserved features in the alignment. For professional presentations, one should use the texshade LaTeX package or boxshade.

The pull-down menus at the top of the window allow you to select all the options required for traditional multiple sequence and profile alignment. You can cut-and-paste sequences to change the order of the alignment; you can select a subset of sequences to be aligned; you can select a sub-range of the alignment to be realigned and inserted back into the original alignment.

An alignment quality analysis can be performed and low-scoring segments or exceptional residues can be highlighted.

Теги: Биология: Clustal/ALN, Протеины, Область: field::biology, field::biology:bioinformatics, Реализовано на: implemented-in::c, interface::commandline, Пользовательский интерфейс: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Область: Утилита, Инструментарий интерфейса: Lesstif/Motif, uitoolkit::qt, use::analysing, Цель: Сравнение, use::viewing, works-with-format::plaintext, Работает с: Требуется дополнительный тег, X Window System: Приложение

Другие пакеты, относящиеся к clustalx

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [m68k]

  библиотека для атомарного выполнения кода

• dep: libc6 (>= 2.29) [m68k]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, m68k, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgl1 [m68k, sparc64]

  работа с GL — поддержка старых программ

• dep: libqt5core5a (>= 5.7.0) [m68k]

  Qt 5 core module

• dep: libqt5core5t64 (>= 5.15.1) [amd64, i386, x32]

  Qt 5 core module

  dep: libqt5core5t64 (>= 5.7.0) [не amd64, i386, m68k, x32]

• dep: libqt5gui5 (>= 5.2.0) [m68k]

  Qt 5 GUI module

  или libqt5gui5-gles (>= 5.2.0)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5gui5t64 (>= 5.2.0) [не m68k]

  Qt 5 GUI module

  или libqt5gui5-gles (>= 5.2.0)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5widgets5 (>= 5.0.2) [m68k]

  Qt 5 widgets module

• dep: libqt5widgets5t64 (>= 5.0.2) [не m68k]

  Qt 5 widgets module

• dep: libqt5xml5 (>= 5.0.2) [m68k]

  Qt 5 XML module

• dep: libqt5xml5t64 (>= 5.0.2) [не m68k]

  Qt 5 XML module

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не m68k]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k]

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

• sug: boxshade

  создание красивых распечаток множественного выравнивания последовательностей

• sug: clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

• sug: texlive-latex-extra

  TeX Live: LaTeX additional packages

Загрузка clustalx

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	2.1+lgpl-9+b1	405,8 Кб	1 659,0 Кб	[список файлов]
amd64	2.1+lgpl-9+b1	445,0 Кб	1 427,0 Кб	[список файлов]
arm64	2.1+lgpl-9+b1	385,0 Кб	1 334,0 Кб	[список файлов]
armel	2.1+lgpl-9+b1	378,0 Кб	1 262,0 Кб	[список файлов]
armhf	2.1+lgpl-9+b1	390,7 Кб	962,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	2.1+lgpl-9+b1	419,9 Кб	1 461,0 Кб	[список файлов]
i386	2.1+lgpl-9+b1	474,3 Кб	1 470,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	2.1+lgpl-9+b1	501,1 Кб	2 574,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	2.1+lgpl-9	416,1 Кб	1 369,0 Кб	[список файлов]
mips64el	2.1+lgpl-9+b1	395,1 Кб	1 726,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	2.1+lgpl-9+b1	423,6 Кб	1 782,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	2.1+lgpl-9+b1	428,8 Кб	1 654,0 Кб	[список файлов]
riscv64	2.1+lgpl-9+b2	433,5 Кб	1 130,0 Кб	[список файлов]
s390x	2.1+lgpl-9+b1	446,3 Кб	1 470,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	2.1+lgpl-9+b1	506,1 Кб	1 336,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	2.1+lgpl-9+b1	356,6 Кб	2 179,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	2.1+lgpl-9+b1	444,7 Кб	1 342,0 Кб	[список файлов]