Пакет: flye (2.9.4+dfsg-1)

[ Источник: flye  ]

de novo assembler for single molecule sequencing reads using repeat graphs

Flye is a de novo assembler for single molecule sequencing reads, such as those produced by PacBio and Oxford Nanopore Technologies. It is designed for a wide range of datasets, from small bacterial projects to large mammalian-scale assemblies. The package represents a complete pipeline: it takes raw PacBio / ONT reads as input and outputs polished contigs. Flye also has a special mode for metagenome assembly.

Другие пакеты, относящиеся к flye

• dep: libc6 (>= 2.38)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не riscv64]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: minimap2

  versatile pairwise aligner for genomic and spliced nucleotide sequences

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

• dep: python3-six

  Python 2 and 3 compatibility library

• dep: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

Загрузка flye

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	22 637,6 Кб	36 914,0 Кб	[список файлов]
arm64	22 558,7 Кб	36 729,0 Кб	[список файлов]
mips64el	22 557,9 Кб	37 104,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	22 638,1 Кб	37 177,0 Кб	[список файлов]
riscv64	22 616,0 Кб	36 509,0 Кб	[список файлов]
s390x	22 668,1 Кб	37 097,0 Кб	[список файлов]