Paketti: flye (2.9.5+dfsg-1)
Links for flye
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti flye:
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
- Étienne Mollier (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [github.com]
Samankaltaisia paketteja:
de novo assembler for single molecule sequencing reads using repeat graphs
Flye is a de novo assembler for single molecule sequencing reads, such as those produced by PacBio and Oxford Nanopore Technologies. It is designed for a wide range of datasets, from small bacterial projects to large mammalian-scale assemblies. The package represents a complete pipeline: it takes raw PacBio / ONT reads as input and outputs polished contigs. Flye also has a special mode for metagenome assembly.
Muut pakettiin flye liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.38)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei riscv64]
- GCC:n apukirjasto
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]
-
- dep: libstdc++6 (>= 14)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
-
- dep: minimap2
- versatile pairwise aligner for genomic and spliced nucleotide sequences
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-six
- Python 2 and 3 compatibility library
-
- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
Imuroi flye
Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|
amd64 | 22,656.8 kt | 36,930.0 kt | [tiedostoluettelo] |
arm64 | 22,576.4 kt | 36,729.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mips64el | 22,574.7 kt | 37,033.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ppc64el | 22,648.1 kt | 37,113.0 kt | [tiedostoluettelo] |
riscv64 | 22,636.1 kt | 36,481.0 kt | [tiedostoluettelo] |
s390x | 22,685.9 kt | 37,085.0 kt | [tiedostoluettelo] |