Пакет: cd-hit (4.8.1-4 и другие)

[ Источник: cd-hit  ]

suite of programs designed to quickly group sequences

cd-hit contains a number of programs designed to quickly group sequences. cd-hit groups proteins into clusters that meet a user-defined similarity threshold. cd-hit-est is similar to cd-hit, but designed to group nucleotide sequences (without introns). cd-hit-est-2d is similar to cd-hit-2d but designed to compare two nucleotide datasets. A number of other related programs are also in this package. Please see the cd-hit user manual, also part of this package, for further information.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c++, implemented-in::perl, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: role::program, use::comparing, Работает с: Биологические последовательности

Другие пакеты, относящиеся к cd-hit

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [не amd64, arm64, ppc64el, riscv64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, i386, riscv64]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [не arm64, riscv64]

• dep: perl

  практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

Загрузка cd-hit

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	4.8.1-4	510,3 Кб	1 411,0 Кб	[список файлов]
arm64	4.8.1-4+b1	496,6 Кб	1 428,0 Кб	[список файлов]
armel	4.8.1-4	491,0 Кб	1 319,0 Кб	[список файлов]
armhf	4.8.1-4	487,6 Кб	1 111,0 Кб	[список файлов]
i386	4.8.1-4	511,4 Кб	1 477,0 Кб	[список файлов]
mips64el	4.8.1-4	510,9 Кб	1 588,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	4.8.1-4	508,7 Кб	1 813,0 Кб	[список файлов]
riscv64	4.8.1-4+b1	505,5 Кб	1 236,0 Кб	[список файлов]
s390x	4.8.1-4	496,6 Кб	1 429,0 Кб	[список файлов]