Pakiet: cd-hit (4.8.1-4 i inne)

[ Pakiet źródłowy: cd-hit  ]

Pakiet programów przeznaczonych do szybkiego grupowania sekwencji

Pakiet cd-hit zawiera szereg programów przeznaczonych do szybkiego grupowania sekwencji. cd-hit grupuje białka w klastry, które spełniają zdefiniowany przez użytkownika próg podobieństwa. cd-hit-est jest podobny do cd-hit, ale przeznaczony do grupowania sekwencji nukleotydowych (bez intronów). cd-hit-est-2d jest podobny do cd-hit-2d, ale przeznaczony do porównywania dwóch zestawów danych nukleotydów. W tym pakiecie znajduje się również wiele innych powiązanych programów. Więcej informacji można znaleźć w podręczniku użytkownika cd-hit, który również jest częścią tego pakietu.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, implemented-in::perl, Interfejs użytkownika: Wiersz poleceń, Rola: role::program, use::comparing, Działa z: Sekwencje biologiczne

Inne pakiety związane z cd-hit

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [nie amd64, arm64, ppc64el, riscv64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, i386, riscv64]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [nie arm64, riscv64]

• dep: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie cd-hit

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	4.8.1-4	510,3 KiB	1 411,0 KiB	[lista plików]
arm64	4.8.1-4+b1	496,6 KiB	1 428,0 KiB	[lista plików]
armel	4.8.1-4	491,0 KiB	1 319,0 KiB	[lista plików]
armhf	4.8.1-4	487,6 KiB	1 111,0 KiB	[lista plików]
i386	4.8.1-4	511,4 KiB	1 477,0 KiB	[lista plików]
mips64el	4.8.1-4	510,9 KiB	1 588,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	4.8.1-4	508,7 KiB	1 813,0 KiB	[lista plików]
riscv64	4.8.1-4+b1	505,5 KiB	1 236,0 KiB	[lista plików]
s390x	4.8.1-4	496,6 KiB	1 429,0 KiB	[lista plików]