Пакет: r-bioc-multtest (2.62.0-2 и другие)

[ Источник: r-bioc-multtest  ]

Bioconductor resampling-based multiple hypothesis testing

Non-parametric bootstrap and permutation resampling-based multiple testing procedures (including empirical Bayes methods) for controlling the family-wise error rate (FWER), generalized family-wise error rate (gFWER), tail probability of the proportion of false positives (TPPFP), and false discovery rate (FDR). Several choices of bootstrap-based null distribution are implemented (centered, centered and scaled, quantile-transformed). Single-step and step-wise methods are available. Tests based on a variety of t- and F-statistics (including t-statistics based on regression parameters from linear and survival models as well as those based on correlation parameters) are included. When probing hypotheses with t-statistics, users may also select a potentially faster null distribution which is multivariate normal with mean zero and variance covariance matrix derived from the vector influence function. Results are reported in terms of adjusted p-values, confidence regions and test statistic cutoffs. The procedures are directly applicable to identifying differentially expressed genes in DNA microarray experiments.

Другие пакеты, относящиеся к r-bioc-multtest

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [не alpha, ia64, loong64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: r-api-4.0

  виртуальный пакет, предоставляемый r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  Пакет недоступен

• dep: r-api-bioc-3.20 [не hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  виртуальный пакет, предоставляемый r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biobase

  base functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-cran-mass

  GNU R package of Venables and Ripley's MASS

• dep: r-cran-survival

  GNU R package for survival analysis

• sug: r-cran-snow

  GNU R package for 'simple network of workstations'

Загрузка r-bioc-multtest

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	2.62.0-2	823,3 Кб	1 074,0 Кб	[список файлов]
amd64	2.62.0-2	823,3 Кб	1 062,0 Кб	[список файлов]
arm64	2.62.0-2	821,7 Кб	1 074,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	2.58.0-1	818,6 Кб	1 063,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	2.58.0-1	824,4 Кб	1 102,0 Кб	[список файлов]
loong64 (неофициальный перенос)	2.62.0-2	822,3 Кб	1 074,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	2.58.0-1	813,5 Кб	1 046,0 Кб	[список файлов]
mips64el	2.62.0-2	821,8 Кб	1 078,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	2.62.0-2	828,0 Кб	1 139,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	2.62.0-2	827,5 Кб	1 074,0 Кб	[список файлов]
riscv64	2.62.0-2	822,9 Кб	1 050,0 Кб	[список файлов]
s390x	2.62.0-2	826,6 Кб	1 070,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	2.58.0-1	818,1 Кб	1 070,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	2.62.0-2	819,7 Кб	2 036,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	2.58.0-1	817,3 Кб	1 049,0 Кб	[список файлов]