Paketti: r-bioc-multtest (2.62.0-2 ja muut)

[ Source: r-bioc-multtest  ]

Bioconductor resampling-based multiple hypothesis testing

Non-parametric bootstrap and permutation resampling-based multiple testing procedures (including empirical Bayes methods) for controlling the family-wise error rate (FWER), generalized family-wise error rate (gFWER), tail probability of the proportion of false positives (TPPFP), and false discovery rate (FDR). Several choices of bootstrap-based null distribution are implemented (centered, centered and scaled, quantile-transformed). Single-step and step-wise methods are available. Tests based on a variety of t- and F-statistics (including t-statistics based on regression parameters from linear and survival models as well as those based on correlation parameters) are included. When probing hypotheses with t-statistics, users may also select a potentially faster null distribution which is multivariate normal with mean zero and variance covariance matrix derived from the vector influence function. Results are reported in terms of adjusted p-values, confidence regions and test statistic cutoffs. The procedures are directly applicable to identifying differentially expressed genes in DNA microarray experiments.

Muut pakettiin r-bioc-multtest liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [ei alpha, ia64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: r-api-4.0

  näennäispaketti, jonka toteuttaa r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  Paketti ei saatavilla

• dep: r-api-bioc-3.20 [ei hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  näennäispaketti, jonka toteuttaa r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biobase

  base functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-cran-mass

  GNU R package of Venables and Ripley's MASS

• dep: r-cran-survival

  GNU R package for survival analysis

• sug: r-cran-snow

  GNU R package for 'simple network of workstations'

Imuroi r-bioc-multtest

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	2.62.0-2	823.3 kt	1,074.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	2.62.0-2	823.3 kt	1,062.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	2.62.0-2	821.7 kt	1,074.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	2.58.0-1	818.6 kt	1,063.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	2.58.0-1	824.4 kt	1,102.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	2.58.0-1	813.5 kt	1,046.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	2.62.0-2	821.8 kt	1,078.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	2.62.0-2	828.0 kt	1,139.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	2.62.0-2	827.5 kt	1,074.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	2.62.0-2	822.9 kt	1,050.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	2.62.0-2	826.6 kt	1,070.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	2.58.0-1	818.1 kt	1,070.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	2.62.0-2	819.7 kt	2,036.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	2.58.0-1	817.3 kt	1,049.0 kt	[tiedostoluettelo]