パッケージ: r-bioc-multtest (2.62.0-2 など)

[ ソース: r-bioc-multtest  ]

Bioconductor resampling-based multiple hypothesis testing

Non-parametric bootstrap and permutation resampling-based multiple testing procedures (including empirical Bayes methods) for controlling the family-wise error rate (FWER), generalized family-wise error rate (gFWER), tail probability of the proportion of false positives (TPPFP), and false discovery rate (FDR). Several choices of bootstrap-based null distribution are implemented (centered, centered and scaled, quantile-transformed). Single-step and step-wise methods are available. Tests based on a variety of t- and F-statistics (including t-statistics based on regression parameters from linear and survival models as well as those based on correlation parameters) are included. When probing hypotheses with t-statistics, users may also select a potentially faster null distribution which is multivariate normal with mean zero and variance covariance matrix derived from the vector influence function. Results are reported in terms of adjusted p-values, confidence regions and test statistic cutoffs. The procedures are directly applicable to identifying differentially expressed genes in DNA microarray experiments.

その他の r-bioc-multtest 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [alpha, ia64, loong64, riscv64, sh4 以外]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: r-api-4.0

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  パッケージは利用できません

• dep: r-api-bioc-3.20 [hppa, ia64, m68k, sh4, x32 以外]

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biobase

  base functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-cran-mass

  GNU R package of Venables and Ripley's MASS

• dep: r-cran-survival

  生存率解析用 GNU R パッケージ

• sug: r-cran-snow

  GNU R package for 'simple network of workstations'

r-bioc-multtest のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	2.62.0-2	823.3 kB	1,074.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	2.62.0-2	823.3 kB	1,062.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	2.62.0-2	821.7 kB	1,074.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	2.58.0-1	818.6 kB	1,063.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	2.58.0-1	824.4 kB	1,102.0 kB	[ファイル一覧]
loong64 (非公式の移植版)	2.62.0-2	822.3 kB	1,074.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	2.58.0-1	813.5 kB	1,046.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	2.62.0-2	821.8 kB	1,078.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	2.62.0-2	828.0 kB	1,139.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	2.62.0-2	827.5 kB	1,074.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	2.62.0-2	822.9 kB	1,050.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	2.62.0-2	826.6 kB	1,070.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	2.58.0-1	818.1 kB	1,070.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	2.62.0-2	819.7 kB	2,036.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	2.58.0-1	817.3 kB	1,049.0 kB	[ファイル一覧]