Пакет: fastqtl (2.184+v7+dfsg-4 и другие)

[ Источник: fastqtl  ]

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Пользовательский интерфейс: interface::commandline, role::program, Цель: Анализ

Другие пакеты, относящиеся к fastqtl

• dep: libblas3

  реализация алгоритмов линейной алгебры — библиотека

  или libblas.so.3

  виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  библиотека Boost.Iostreams

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  program options library for C++

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)

• dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, ia64, loong64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.39) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1) [ia64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg) [не ia64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgslcblas0 (>= 2.8) [sparc64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [alpha, ia64, loong64, m68k, sh4]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [не alpha, ia64, loong64, m68k, sh4]

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

• dep: r-mathlib (>= 4.3.3) [ia64]

  GNU R standalone mathematics library

  dep: r-mathlib (>= 4.4.1) [не ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  библиотека сжатия

• rec: r-cran-argparser

  GNU R command-line argument parser

• rec: r-cran-qvalue

  Пакет недоступен

• rec: r-cran-tools

  Пакет недоступен

• sug: fastqtl-doc

  QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

Загрузка fastqtl

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	2.184+v7+dfsg-4+b4	194,1 Кб	793,0 Кб	[список файлов]
amd64	2.184+v7+dfsg-4+b3	237,4 Кб	790,0 Кб	[список файлов]
arm64	2.184+v7+dfsg-4+b3	202,7 Кб	726,0 Кб	[список файлов]
armel	2.184+v7+dfsg-4+b3	187,2 Кб	661,0 Кб	[список файлов]
armhf	2.184+v7+dfsg-4+b3	189,4 Кб	497,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	2.184+v7+dfsg-4+b3	199,8 Кб	644,0 Кб	[список файлов]
i386	2.184+v7+dfsg-4+b3	234,8 Кб	769,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	2.184+v7+dfsg-4+b2	252,5 Кб	1 260,0 Кб	[список файлов]
loong64 (неофициальный перенос)	2.184+v7+dfsg-4+b3	204,6 Кб	710,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	2.184+v7+dfsg-4+b3	206,0 Кб	717,0 Кб	[список файлов]
mips64el	2.184+v7+dfsg-4+b3	195,1 Кб	821,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	2.184+v7+dfsg-4+b3	213,5 Кб	854,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	2.184+v7+dfsg-4+b3	243,8 Кб	918,0 Кб	[список файлов]
riscv64	2.184+v7+dfsg-4+b3	208,9 Кб	566,0 Кб	[список файлов]
s390x	2.184+v7+dfsg-4+b3	219,1 Кб	758,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	2.184+v7+dfsg-4+b3	257,6 Кб	726,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	2.184+v7+dfsg-4+b3	177,3 Кб	1 116,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	2.184+v7+dfsg-4+b4	238,8 Кб	741,0 Кб	[список файлов]