Пакет: fastqtl (2.184+v7+dfsg-3)

[ Источник: fastqtl  ]

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Пользовательский интерфейс: interface::commandline, role::program, Цель: Анализ

Другие пакеты, относящиеся к fastqtl

• dep: libblas3

  реализация алгоритмов линейной алгебры — библиотека

  или libblas.so.3

  виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  библиотека Boost.Iostreams

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

  program options library for C++

• dep: libc6 (>= 2.34)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: r-mathlib

  GNU R standalone mathematics library

• rec: r-cran-argparser

  GNU R command-line argument parser

• rec: r-cran-qvalue

  Пакет недоступен

• rec: r-cran-tools

  Пакет недоступен

• sug: fastqtl-doc

  QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

Загрузка fastqtl

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	228,7 Кб	772,0 Кб	[список файлов]
arm64	197,1 Кб	724,0 Кб	[список файлов]
armel	184,0 Кб	659,0 Кб	[список файлов]
armhf	186,6 Кб	531,0 Кб	[список файлов]
i386	228,7 Кб	767,0 Кб	[список файлов]
mips64el	194,8 Кб	885,0 Кб	[список файлов]
mipsel	198,4 Кб	879,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	245,2 Кб	916,0 Кб	[список файлов]
s390x	192,3 Кб	752,0 Кб	[список файлов]