套件：fastqtl（2.184+v7+dfsg-4 以及其他的）

[ 原始碼： fastqtl  ]

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

標籤: 領域: 生物學, 生物資訊學, 使用者介面: interface::commandline, role::program, Purpose: Analysing

其他與 fastqtl 有關的套件

• dep: libblas3

  Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library

  或者 libblas.so.3

  本虛擬套件由這些套件填實： libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  Boost.Iostreams Library

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  program options library for C++

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [除 alpha, ia64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 支援函式庫

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支援函式庫

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 支援函式庫

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1) [ia64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg) [除 ia64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgslcblas0 (>= 2.8) [sparc64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [alpha, ia64, m68k, sh4]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [除 alpha, ia64, m68k, sh4]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: r-mathlib (>= 4.3.3) [ia64]

  GNU R standalone mathematics library

  dep: r-mathlib (>= 4.4.1) [除 ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)

• rec: r-cran-argparser

  GNU R command-line argument parser

• rec: r-cran-qvalue

  套件暫時不可用

• rec: r-cran-tools

  套件暫時不可用

• sug: fastqtl-doc

  QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

下載 fastqtl

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	2.184+v7+dfsg-4+b4	194。1 kB	793。0 kB	[檔案列表]
amd64	2.184+v7+dfsg-4+b3	237。4 kB	790。0 kB	[檔案列表]
arm64	2.184+v7+dfsg-4+b3	202。7 kB	726。0 kB	[檔案列表]
armel	2.184+v7+dfsg-4+b3	187。2 kB	661。0 kB	[檔案列表]
armhf	2.184+v7+dfsg-4+b3	189。4 kB	497。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	2.184+v7+dfsg-4+b3	199。8 kB	644。0 kB	[檔案列表]
i386	2.184+v7+dfsg-4+b3	234。8 kB	769。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	2.184+v7+dfsg-4+b2	252。5 kB	1，260。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	2.184+v7+dfsg-4+b3	206。0 kB	717。0 kB	[檔案列表]
mips64el	2.184+v7+dfsg-4+b3	195。1 kB	821。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	2.184+v7+dfsg-4+b3	213。5 kB	854。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	2.184+v7+dfsg-4+b3	243。8 kB	918。0 kB	[檔案列表]
riscv64	2.184+v7+dfsg-4+b3	208。9 kB	566。0 kB	[檔案列表]
s390x	2.184+v7+dfsg-4+b3	219。1 kB	758。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	2.184+v7+dfsg-4+b3	257。6 kB	726。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	2.184+v7+dfsg-4+b3	177。3 kB	1，116。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	2.184+v7+dfsg-4+b4	238。8 kB	741。0 kB	[檔案列表]