Paket: fastqtl (2.184+v7+dfsg-4 und andere)

[ Quellcode: fastqtl  ]

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Benutzer-Schnittstellen: interface::commandline, role::program, Zweck: Analyse

Andere Pakete mit Bezug zu fastqtl

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• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

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• dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [nicht alpha, ia64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

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  GNU Scientific Library -- Bibliothekspaket

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg) [nicht ia64]

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• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [alpha, ia64, m68k, sh4]

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  dep: libstdc++6 (>= 14) [nicht alpha, ia64, m68k, sh4]

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  GNU R command-line argument parser

• rec: r-cran-qvalue

  Paket nicht verfügbar

• rec: r-cran-tools

  Paket nicht verfügbar

• sug: fastqtl-doc

  QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

fastqtl herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	2.184+v7+dfsg-4+b4	194,1 kB	793,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	2.184+v7+dfsg-4+b3	237,4 kB	790,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	2.184+v7+dfsg-4+b3	202,7 kB	726,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	2.184+v7+dfsg-4+b3	187,2 kB	661,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	2.184+v7+dfsg-4+b3	189,4 kB	497,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	2.184+v7+dfsg-4+b3	199,8 kB	644,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	2.184+v7+dfsg-4+b3	234,8 kB	769,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	2.184+v7+dfsg-4+b2	252,5 kB	1.260,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	2.184+v7+dfsg-4+b3	206,0 kB	717,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	2.184+v7+dfsg-4+b3	195,1 kB	821,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	2.184+v7+dfsg-4+b3	213,5 kB	854,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	2.184+v7+dfsg-4+b3	243,8 kB	918,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	2.184+v7+dfsg-4+b3	208,9 kB	566,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	2.184+v7+dfsg-4+b3	219,1 kB	758,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	2.184+v7+dfsg-4+b3	257,6 kB	726,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	2.184+v7+dfsg-4+b3	177,3 kB	1.116,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	2.184+v7+dfsg-4+b4	238,8 kB	741,0 kB	[Liste der Dateien]