Пакет: cufflinks (2.2.1+dfsg.1-8 и другие) [non-free]

[ Источник: cufflinks  ]

Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq

Cufflinks assembles transcripts, estimates their abundances, and tests for differential expression and regulation in RNA-Seq samples. It accepts aligned RNA-Seq reads and assembles the alignments into a parsimonious set of transcripts. Cufflinks then estimates the relative abundances of these transcripts based on how many reads support each one.

Теги: Биология: Нуклеиновые кислоты, Область: Биология, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, Роль: Программа, Работает с: Биологические последовательности

Другие пакеты, относящиеся к cufflinks

• dep: libboost-serialization1.74.0 (>= 1.74.0)

  serialization library for C++

• dep: libboost-thread1.74.0 (>= 1.74.0)

  portable C++ multi-threading

• dep: libc6 (>= 2.29)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.0) [amd64, armel, armhf]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.1) [s390x]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  библиотека сжатия

• rec: gffread

  GFF/GTF format conversions, region filtering, FASTA sequence extraction

• enh: tophat

  Пакет недоступен

Загрузка cufflinks

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1 500,5 Кб	10 384,0 Кб	[список файлов]
arm64	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1 390,1 Кб	9 869,0 Кб	[список файлов]
armel	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1 211,9 Кб	9 133,0 Кб	[список файлов]
armhf	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1 114,3 Кб	6 213,0 Кб	[список файлов]
i386	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1 522,5 Кб	10 603,0 Кб	[список файлов]
mips64el	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1 561,7 Кб	15 202,0 Кб	[список файлов]
mipsel	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1 500,6 Кб	13 369,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1 549,2 Кб	13 797,0 Кб	[список файлов]
s390x	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1 314,2 Кб	10 901,0 Кб	[список файлов]