パッケージ: fastqtl (2.184+v7+dfsg-3)

[ ソース: fastqtl  ]

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, ユーザインタフェース: interface::commandline, role::program, 目的: 解析

その他の fastqtl 関連パッケージ

• dep: libblas3

  基本線形代数のリファレンス実装 - 共有ライブラリ

  または libblas.so.3

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  Boost.Iostreams ライブラリ

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

  C++ 用プログラムオプションライブラリ

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: r-mathlib

  GNU R - スタンドアローンな数学ライブラリ

• rec: r-cran-argparser

  GNU R command-line argument parser

• rec: r-cran-qvalue

  パッケージは利用できません

• rec: r-cran-tools

  パッケージは利用できません

• sug: fastqtl-doc

  QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

fastqtl のダウンロード

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アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	228.7 kB	772.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	197.1 kB	724.0 kB	[ファイル一覧]
armel	184.0 kB	659.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	186.6 kB	531.0 kB	[ファイル一覧]
i386	228.7 kB	767.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	194.8 kB	885.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	198.4 kB	879.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	245.2 kB	916.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	192.3 kB	752.0 kB	[ファイル一覧]