Balík: fastqtl (2.184+v7+dfsg-3)

[ Zdroj: fastqtl  ]

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

Značky: Pole: Biológia, Bioinformatika, User Interface: interface::commandline, role::program, Purpose: Analyzovanie

Ostatné balíky súvisiace s balíkom fastqtl

• dep: libblas3

  referenčné implementácie základnej lineárnej algebry - zdieľaná knižnica

  alebo libblas.so.3

  virtuálny balík poskytovaný balíkom libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  knižnica Boost.Iostreams

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

  knižnica volieb programu pre C++

• dep: libc6 (>= 2.34)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

  GNU Scientific Library (GSL) - balík knižnice

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: r-mathlib

  GNU R standalone mathematics library

• rec: r-cran-argparser

  GNU R command-line argument parser

• rec: r-cran-qvalue

  Balík nie je dostupný

• rec: r-cran-tools

  Balík nie je dostupný

• sug: fastqtl-doc

  QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

Stiahnuť fastqtl

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	228.7 kB	772.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	197.1 kB	724.0 kB	[zoznam súborov]
armel	184.0 kB	659.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	186.6 kB	531.0 kB	[zoznam súborov]
i386	228.7 kB	767.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	194.8 kB	885.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	198.4 kB	879.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	245.2 kB	916.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	192.3 kB	752.0 kB	[zoznam súborov]