Пакет: velvet (1.2.10+dfsg1-9)

[ Источник: velvet  ]

Nucleic acid sequence assembler for very short reads

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c, interface::commandline, Роль: Программа, Цель: Анализ

Другие пакеты, относящиеся к velvet

• dep: libc6 (>= 2.34)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2) [не armel, armhf]

  библиотека сжатия

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [armel, armhf]

• sug: velvet-example

  Example data for the Velvet sequence assembler

Загрузка velvet

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	662,2 Кб	1 276,0 Кб	[список файлов]
arm64	642,6 Кб	1 399,0 Кб	[список файлов]
armel	659,7 Кб	1 364,0 Кб	[список файлов]
armhf	643,7 Кб	1 052,0 Кб	[список файлов]
i386	688,9 Кб	1 466,0 Кб	[список файлов]
mips64el	658,0 Кб	1 511,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	669,4 Кб	1 590,0 Кб	[список файлов]
riscv64	700,9 Кб	1 332,0 Кб	[список файлов]
s390x	662,4 Кб	1 337,0 Кб	[список файлов]