Pakiet: velvet (1.2.10+dfsg1-9)

[ Pakiet źródłowy: velvet  ]

Nucleic acid sequence assembler for very short reads

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Przeznaczenie: Analizowanie

Inne pakiety związane z velvet

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2) [nie armel, armhf]

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [armel, armhf]

• sug: velvet-example

  Example data for the Velvet sequence assembler

Pobieranie velvet

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	662,2 KiB	1 276,0 KiB	[lista plików]
arm64	642,6 KiB	1 399,0 KiB	[lista plików]
armel	659,7 KiB	1 364,0 KiB	[lista plików]
armhf	643,7 KiB	1 052,0 KiB	[lista plików]
i386	688,9 KiB	1 466,0 KiB	[lista plików]
mips64el	658,0 KiB	1 511,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	669,4 KiB	1 590,0 KiB	[lista plików]
riscv64	700,9 KiB	1 332,0 KiB	[lista plików]
s390x	662,4 KiB	1 337,0 KiB	[lista plików]