Pacote: bitseq (0.7.5+dfsg-6 e outros)

[ Fonte: bitseq  ]

Bayesian Inference of Transcripts from Sequencing Data

BitSeq is an application for inferring expression levels of individual transcripts from sequencing (RNA-Seq) data and estimating differential expression (DE) between conditions. An advantage of this approach is the ability to account for both technical uncertainty and intrinsic biological variance in order to avoid false DE calls. The technical contribution to the uncertainty comes both from finite read-depth and the possibly ambiguous mapping of reads to multiple transcripts.

Outros pacotes relacionados a bitseq

• dep: libc6 (>= 2.29) [não arm64, riscv64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64, riscv64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, s390x]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el, riscv64]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  biblioteca de suporte ao GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 11) [arm64, riscv64]

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [não arm64, riscv64]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-numpy

  Python library for numerical computations (Python 3)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Download de bitseq

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	0.7.5+dfsg-6	337.2 kB	1,927.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	0.7.5+dfsg-6+b2	305.6 kB	2,216.0 kB	[lista de arquivos]
armel	0.7.5+dfsg-6	282.4 kB	1,606.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	0.7.5+dfsg-6	286.8 kB	1,158.0 kB	[lista de arquivos]
i386	0.7.5+dfsg-6	362.5 kB	2,022.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	0.7.5+dfsg-6	320.9 kB	2,167.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	0.7.5+dfsg-6	343.5 kB	2,471.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	0.7.5+dfsg-6+b3	336.6 kB	1,456.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	0.7.5+dfsg-6	297.6 kB	1,955.0 kB	[lista de arquivos]