Pacote: bitseq (0.7.5+dfsg-5)

[ Fonte: bitseq  ]

Bayesian Inference of Transcripts from Sequencing Data

BitSeq is an application for inferring expression levels of individual transcripts from sequencing (RNA-Seq) data and estimating differential expression (DE) between conditions. An advantage of this approach is the ability to account for both technical uncertainty and intrinsic biological variance in order to avoid false DE calls. The technical contribution to the uncertainty comes both from finite read-depth and the possibly ambiguous mapping of reads to multiple transcripts.

Outros pacotes relacionados a bitseq

• dep: libc6 (>= 2.23)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, i386, mipsel, s390x]

  Pacote não disponível

  dep: libgcc1 (>= 1:3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [arm64, mips64el]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  biblioteca de suporte ao GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: python3

  linguagem orientada a objetos de alto nível e interativa (versão padrão da python3)

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python 3 language

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Download de bitseq

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	339.9 kB	1,875.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	299.7 kB	1,651.0 kB	[lista de arquivos]
armel	282.5 kB	1,522.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	288.6 kB	1,106.0 kB	[lista de arquivos]
i386	358.3 kB	1,906.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	329.5 kB	2,194.0 kB	[lista de arquivos]
mipsel	330.5 kB	2,052.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	339.9 kB	2,407.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	299.3 kB	1,887.0 kB	[lista de arquivos]