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postprocessing and classification of LTR retrotransposons

LTRsift is a graphical desktop tool for semi-automatic postprocessing of de novo predicted LTR retrotransposon annotations, such as the ones generated by LTRharvest and LTRdigest. Its user-friendly interface displays LTR retrotransposon candidates, their putative families and their internal structure in a hierarchical fashion, allowing the user to "sift" through the sometimes large results of de novo prediction software. It also offers customizable filtering and classification functionality.

Etiquetas: Campo: Biologia, Bioinformática, Implementado em: implemented-in::c, interface::commandline, Interface de usuário(a): Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Alcance: Utilitários, Kit de ferramentas de interface: GTK, Propósito: use::analysing, use::browsing, Comparação, Organização de dados, use::viewing, x11::application

Outros pacotes relacionados a ltrsift

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Arquitetura Versão Tamanho do pacote Tamanho instalado Arquivos
alpha (porte não oficial) 1.0.2-10 92.6 kB468.0 kB [lista de arquivos]
amd64 1.0.2-10 96.6 kB364.0 kB [lista de arquivos]
arm64 1.0.2-10+b1 88.9 kB465.0 kB [lista de arquivos]
armel 1.0.2-10 87.6 kB326.0 kB [lista de arquivos]
armhf 1.0.2-10 87.5 kB278.0 kB [lista de arquivos]
hppa (porte não oficial) 1.0.2-10 91.3 kB337.0 kB [lista de arquivos]
i386 1.0.2-10 106.3 kB410.0 kB [lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial) 1.0.2-10 109.0 kB561.0 kB [lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial) 1.0.2-10 91.9 kB372.0 kB [lista de arquivos]
m68k (porte não oficial) 1.0.2-10 87.5 kB334.0 kB [lista de arquivos]
mips64el 1.0.2-10 83.3 kB479.0 kB [lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial) 1.0.2-10 98.5 kB528.0 kB [lista de arquivos]
ppc64el 1.0.2-10 98.0 kB464.0 kB [lista de arquivos]
riscv64 1.0.2-10 95.9 kB316.0 kB [lista de arquivos]
s390x 1.0.2-10 90.7 kB364.0 kB [lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial) 1.0.2-10 106.9 kB400.0 kB [lista de arquivos]
x32 (porte não oficial) 1.0.2-10 97.8 kB346.0 kB [lista de arquivos]