Pacote: ltrsift (1.0.2-10 e outros)

[ Fonte: ltrsift  ]

postprocessing and classification of LTR retrotransposons

LTRsift is a graphical desktop tool for semi-automatic postprocessing of de novo predicted LTR retrotransposon annotations, such as the ones generated by LTRharvest and LTRdigest. Its user-friendly interface displays LTR retrotransposon candidates, their putative families and their internal structure in a hierarchical fashion, allowing the user to "sift" through the sometimes large results of de novo prediction software. It also offers customizable filtering and classification functionality.

Etiquetas: Campo: Biologia, Bioinformática, Implementado em: implemented-in::c, interface::commandline, Interface de usuário(a): Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Alcance: Utilitários, Kit de ferramentas de interface: GTK, Propósito: use::analysing, use::browsing, Comparação, Organização de dados, use::viewing, x11::application

Outros pacotes relacionados a ltrsift

• dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  biblioteca gráfica de vetores 2D Cairo

• dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.22.0)

  biblioteca de Pixbuf GDK

• dep: libgenometools0t64 (>= 1.6.5+ds)

  versatile genome analysis library

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3) [não arm64]

  biblioteca GLib de rotinas C

  dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.76.0) [arm64]

• dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.18.0)

  GTK graphical user interface library - old version

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  layout e renderização de texto internacionalizado

• rec: last-align

  genome-scale comparison of biological sequences

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

Download de ltrsift

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	1.0.2-10	92.6 kB	468.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	1.0.2-10	96.6 kB	364.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1.0.2-10+b1	88.9 kB	465.0 kB	[lista de arquivos]
armel	1.0.2-10	87.6 kB	326.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	1.0.2-10	87.5 kB	278.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	1.0.2-10	91.3 kB	337.0 kB	[lista de arquivos]
i386	1.0.2-10	106.3 kB	410.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	1.0.2-10	109.0 kB	561.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	1.0.2-10	91.9 kB	372.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	1.0.2-10	87.5 kB	334.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	1.0.2-10	83.3 kB	479.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	1.0.2-10	98.5 kB	528.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1.0.2-10	98.0 kB	464.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1.0.2-10	95.9 kB	316.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	1.0.2-10	90.7 kB	364.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	1.0.2-10	106.9 kB	400.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	1.0.2-10	97.8 kB	346.0 kB	[lista de arquivos]