Pakiet: ltrsift (1.0.2-10 i inne)

[ Pakiet źródłowy: ltrsift  ]

postprocessing and classification of LTR retrotransposons

LTRsift is a graphical desktop tool for semi-automatic postprocessing of de novo predicted LTR retrotransposon annotations, such as the ones generated by LTRharvest and LTRdigest. Its user-friendly interface displays LTR retrotransposon candidates, their putative families and their internal structure in a hierarchical fashion, allowing the user to "sift" through the sometimes large results of de novo prediction software. It also offers customizable filtering and classification functionality.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Interfejs użytkownika: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Zakres: Narzędzie, Pakiet narzędziowy interfejsu: GTK, Przeznaczenie: use::analysing, use::browsing, Porównywanie, Organizowanie danych, use::viewing, x11::application

Inne pakiety związane z ltrsift

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  Cairo - biblioteka do dwuwymiarowej grafiki wektorowej

• dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.22.0)

  Biblioteka GDK Pixbuf

• dep: libgenometools0t64 (>= 1.6.5+ds)

  versatile genome analysis library

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3) [nie arm64]

  Glib, biblioteka funkcji języka C

  dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.76.0) [arm64]

• dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.18.0)

  GTK graphical user interface library - old version

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Rozmieszeczenie i rendering umiędzynarodowionego tekstu

• rec: last-align

  Porównywanie sekwencji biologicznych w skali genomu

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

Pobieranie ltrsift

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.0.2-10	92,6 KiB	468,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.0.2-10	96,6 KiB	364,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.0.2-10+b1	88,9 KiB	465,0 KiB	[lista plików]
armel	1.0.2-10	87,6 KiB	326,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.0.2-10	87,5 KiB	278,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.0.2-10	91,3 KiB	337,0 KiB	[lista plików]
i386	1.0.2-10	106,3 KiB	410,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.0.2-10	109,0 KiB	561,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.0.2-10	87,5 KiB	334,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.0.2-10	83,3 KiB	479,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.0.2-10	98,5 KiB	528,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.0.2-10	98,0 KiB	464,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.0.2-10	95,9 KiB	316,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.0.2-10	90,7 KiB	364,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.0.2-10	106,9 KiB	400,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.0.2-10	97,8 KiB	346,0 KiB	[lista plików]