Package: ltrsift (1.0.2-10 and others)

[ Source: ltrsift  ]

post-elaborazione e classificazione di retrotrasposoni LTR

LTRsift è uno strumento grafico per desktop che fa post-elaborazione semi-automatica delle annotazioni di retrotrasposoni LTR predetti de novo, come quelle generate da LTRharvest e LTRdigest. La sua interfaccia facile da usare mostra i candidati per i retrotrasposoni LTR, le loro famiglie putative e la loro struttura in modo gerarchico, permettendo all'utente di "vagliare" ("sift") i risultati, a volte numerosi, del software di predizione de novo. Offre anche funzionalità di filtraggio e di classificazione personalizzabili.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, User Interface: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Scope: Utility, Interface Toolkit: GTK, Purpose: use::analysing, use::browsing, Comparing, Data Organisation, use::viewing, x11::application

Other Packages Related to ltrsift

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

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  libreria Cairo per grafica 2D vettoriale

• dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.22.0)

  libreria GDK Pixbuf

• dep: libgenometools0t64 (>= 1.6.5+ds)

  libreria versatile di analisi del genoma

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3) [not arm64]

  libreria GLib di routine in C

  dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.76.0) [arm64]

• dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.18.0)

  libreria per interfacce utente grafiche GTK - vecchia versione

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  impaginazione e rendering di testo internazionalizzato

• rec: last-align

  confronto di sequenze biologiche su scala genomica

• rec: ncbi-blast+

  suite di prossima generazione degli strumenti di ricerca di sequenze BLAST

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	1.0.2-10	92.6 kB	468.0 kB	[list of files]
amd64	1.0.2-10	96.6 kB	364.0 kB	[list of files]
arm64	1.0.2-10+b1	88.9 kB	465.0 kB	[list of files]
armel	1.0.2-10	87.6 kB	326.0 kB	[list of files]
armhf	1.0.2-10	87.5 kB	278.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	1.0.2-10	91.3 kB	337.0 kB	[list of files]
i386	1.0.2-10	106.3 kB	410.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	1.0.2-10	109.0 kB	561.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	1.0.2-10	87.5 kB	334.0 kB	[list of files]
mips64el	1.0.2-10	83.3 kB	479.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	1.0.2-10	98.5 kB	528.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.0.2-10	98.0 kB	464.0 kB	[list of files]
riscv64	1.0.2-10	95.9 kB	316.0 kB	[list of files]
s390x	1.0.2-10	90.7 kB	364.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	1.0.2-10	106.9 kB	400.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	1.0.2-10	97.8 kB	346.0 kB	[list of files]