Pacote: ltrsift (1.0.2-8)

[ Fonte: ltrsift  ]

postprocessing and classification of LTR retrotransposons

LTRsift is a graphical desktop tool for semi-automatic postprocessing of de novo predicted LTR retrotransposon annotations, such as the ones generated by LTRharvest and LTRdigest. Its user-friendly interface displays LTR retrotransposon candidates, their putative families and their internal structure in a hierarchical fashion, allowing the user to "sift" through the sometimes large results of de novo prediction software. It also offers customizable filtering and classification functionality.

Etiquetas: Campo: Biologia, Bioinformática, Implementado em: implemented-in::c, interface::commandline, Interface de usuário(a): Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Alcance: Utilitários, Kit de ferramentas de interface: GTK, Propósito: use::analysing, use::browsing, Comparação, Organização de dados, use::viewing, x11::application

Outros pacotes relacionados a ltrsift

• dep: libatk1.0-0 (>= 1.12.4)

  Kit de ferramenta de acessibilidade ATK

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [não arm64]

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  biblioteca gráfica de vetores 2D Cairo

• dep: libfontconfig1 (>= 2.12.6)

  biblioteca genérica de configuração de fontes - tempo de execução

• dep: libfreetype6 (>= 2.2.1)

  mecanismo de fontes FreeType 2, biblioteca compartilhada

• dep: libgdk-pixbuf2.0-0 (>= 2.22.0)

  biblioteca de Pixbuf GDK

• dep: libgenometools0

  versatile genome analysis library

• dep: libglib2.0-0 (>= 2.35.9)

  biblioteca GLib de rotinas C

• dep: libgtk2.0-0 (>= 2.18.0)

  biblioteca de interface gráfica de usuário GTK+

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  layout e renderização de texto internacionalizado

• dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0)

  layout e renderização de texto internacionalizado

• dep: libpangoft2-1.0-0 (>= 1.14.0)

  layout e renderização de texto internacionalizado

• rec: last-align

  genome-scale comparison of biological sequences

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

Download de ltrsift

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	106.7 kB	376.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	90.1 kB	340.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	94.5 kB	275.0 kB	[lista de arquivos]
i386	119.1 kB	447.0 kB	[lista de arquivos]