Pacote: autodock (4.2.6-9 e outros)

[ Fonte: autodocksuite  ]

análise das ligações do ligante à estrutura de proteína

AutoDock é um representante único dos programas que tratam a simulação da atracagem indo de ligantes químicos bem pequenos até receptores grandes de proteínas. Versões anteriores tinham toda a flexibilidade nos ligantes enquanto a proteína era mantida rígida. Esta última versão 4 também permite flexibilidade de cadeias laterais selecionadas dos resíduos de superfície, i.e., leva os "rotamers" em consideração.

O programa AutoDock realiza a atracagem do ligante a um conjunto de grades descrevendo a proteína alvo. O AutoGrid pré-calcula estas grades.

Etiquetas: Campo: Biologia, Biologia estrutural, Implementado em: implemented-in::c, interface::commandline, Função: Programa, Alcance: Utilitários, Propósito: use::analysing, works-with-format::TODO, Funciona com: Modelo 3D, Precisa de uma etiqueta extra

Outros pacotes relacionados a autodock

• dep: libc6 (>= 2.29) [não alpha, arm64, ia64, loong64, riscv64, sh4]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.33) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.36) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64, riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.33) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [alpha, amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, s390x, sparc64, x32]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - execução

• sug: autogrid

  pré-calcula ligações de ligantes aos seus receptores

Download de autodock

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	4.2.6-9	176.2 kB	460.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	4.2.6-9	163.5 kB	411.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	4.2.6-9+b2	162.4 kB	433.0 kB	[lista de arquivos]
armel	4.2.6-9	156.7 kB	403.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	4.2.6-9	151.7 kB	315.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	4.2.6-9	169.2 kB	396.0 kB	[lista de arquivos]
i386	4.2.6-9	161.5 kB	411.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	4.2.6-9	218.2 kB	788.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	4.2.6-9	161.0 kB	417.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	4.2.6-9	157.0 kB	455.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	4.2.6-9	165.0 kB	460.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	4.2.6-9	164.6 kB	499.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	4.2.6-9	164.4 kB	435.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	4.2.6-9+b2	173.4 kB	373.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	4.2.6-9	149.3 kB	395.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	4.2.6-9	197.2 kB	388.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	4.2.6-9	162.7 kB	470.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	4.2.6-9	163.3 kB	399.0 kB	[lista de arquivos]