Pacote: autodock (4.2.6-9)

[ Fonte: autodocksuite  ]

análise das ligações do ligante à estrutura de proteína

AutoDock é um representante único dos programas que tratam a simulação da atracagem indo de ligantes químicos bem pequenos até receptores grandes de proteínas. Versões anteriores tinham toda a flexibilidade nos ligantes enquanto a proteína era mantida rígida. Esta última versão 4 também permite flexibilidade de cadeias laterais selecionadas dos resíduos de superfície, i.e., leva os "rotamers" em consideração.

O programa AutoDock realiza a atracagem do ligante a um conjunto de grades descrevendo a proteína alvo. O AutoGrid pré-calcula estas grades.

Etiquetas: Campo: Biologia, Biologia estrutural, Implementado em: implemented-in::c, interface::commandline, Função: Programa, Alcance: Utilitários, Propósito: use::analysing, works-with-format::TODO, Funciona com: Modelo 3D, Precisa de uma etiqueta extra

Outros pacotes relacionados a autodock

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [não armel, armhf, ppc64el]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• sug: autogrid

  pré-calcula ligações de ligantes aos seus receptores

Download de autodock

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	163.5 kB	411.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	150.7 kB	375.0 kB	[lista de arquivos]
armel	156.7 kB	403.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	151.7 kB	315.0 kB	[lista de arquivos]
i386	161.5 kB	411.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	165.0 kB	460.0 kB	[lista de arquivos]
mipsel	170.5 kB	454.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	164.4 kB	435.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	149.3 kB	395.0 kB	[lista de arquivos]