Pakiet: autodock (4.2.6-9 i inne)

[ Pakiet źródłowy: autodocksuite  ]

analysis of ligand binding to protein structure

AutoDock is a prime representative of the programs addressing the simulation of the docking of fairly small chemical ligands to rather big protein receptors. Earlier versions had all flexibility in the ligands while the protein was kept rather ridgid. This latest version 4 also allows for a flexibility of selected sidechains of surface residues, i.e., takes the rotamers into account.

The AutoDock program performs the docking of the ligand to a set of grids describing the target protein. AutoGrid pre-calculates these grids.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Biologia strukturalna, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::analysing, works-with-format::TODO, Działa z: Modele 3D, Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z autodock

• dep: libc6 (>= 2.29) [nie alpha, arm64, ia64, riscv64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.33) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.33) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nie armel, armhf, hppa, ia64, m68k, ppc64, ppc64el, sh4]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• sug: autogrid

  Wstępnie obliczanie wiązania ligandów z ich receptorem

Pobieranie autodock

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	4.2.6-9	176,2 KiB	460,0 KiB	[lista plików]
amd64	4.2.6-9	163,5 KiB	411,0 KiB	[lista plików]
arm64	4.2.6-9+b1	162,2 KiB	433,0 KiB	[lista plików]
armel	4.2.6-9	156,7 KiB	403,0 KiB	[lista plików]
armhf	4.2.6-9	151,7 KiB	315,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	4.2.6-9	169,2 KiB	396,0 KiB	[lista plików]
i386	4.2.6-9	161,5 KiB	411,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	4.2.6-9	218,2 KiB	788,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	4.2.6-9	157,0 KiB	455,0 KiB	[lista plików]
mips64el	4.2.6-9	165,0 KiB	460,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	4.2.6-9	164,6 KiB	499,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	4.2.6-9	164,4 KiB	435,0 KiB	[lista plików]
riscv64	4.2.6-9+b1	169,2 KiB	373,0 KiB	[lista plików]
s390x	4.2.6-9	149,3 KiB	395,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	4.2.6-9	197,2 KiB	388,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	4.2.6-9	162,7 KiB	470,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	4.2.6-9	163,3 KiB	399,0 KiB	[lista plików]