Pacote: anfo (0.98-9)

[ Fonte: anfo  ]

Short Read Aligner/Mapper from MPG

Anfo is a mapper in the spirit of Soap/Maq/Bowtie, but its implementation takes more after BLAST/BLAT. It's most useful for the alignment of sequencing reads where the DNA sequence is somehow modified (think ancient DNA or bisulphite treatment) and/or there is more divergence between sample and reference than what fast mappers will handle gracefully (say the reference genome is missing and a related species is used instead).

Outros pacotes relacionados a anfo

• dep: libanfo0 (>= 0.98)

  Library for Short Read Aligner/Mapper from MPG

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  bib. de alta qualid. de compactação de arqs. bas. em ordenação de blocos - exec

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [não alpha, ia64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.32) [ia64]

• dep: libelk0

  implementação do Scheme (O kit de linguagem de extensão)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libpopt0 (>= 1.14)

  Biblioteca para analisar parâmetros de linha de comando.

• dep: libprotobuf17 [ia64]

  protocol buffers C++ library

• dep: libprotobuf23 (>= 3.12.4) [não ia64]

  protocol buffers C++ library

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - execução

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

Download de anfo

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	113.7 kB	446.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	113.9 kB	439.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	105.0 kB	395.0 kB	[lista de arquivos]
armel	100.0 kB	345.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	101.9 kB	305.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	115.0 kB	387.0 kB	[lista de arquivos]
i386	119.5 kB	413.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	135.6 kB	620.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	113.7 kB	405.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	109.6 kB	438.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	115.0 kB	619.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	114.9 kB	619.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64 (porte não oficial)	109.9 kB	361.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	104.1 kB	411.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	125.5 kB	383.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	100.0 kB	418.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	113.9 kB	389.0 kB	[lista de arquivos]