Пакет: anfo (0.98-9)

[ Източник: anfo  ]

Short Read Aligner/Mapper from MPG

Anfo is a mapper in the spirit of Soap/Maq/Bowtie, but its implementation takes more after BLAST/BLAT. It's most useful for the alignment of sequencing reads where the DNA sequence is somehow modified (think ancient DNA or bisulphite treatment) and/or there is more divergence between sample and reference than what fast mappers will handle gracefully (say the reference genome is missing and a related species is used instead).

Други пакети, свързани с anfo

• dep: libanfo0 (>= 0.98)

  Library for Short Read Aligner/Mapper from MPG

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [не alpha, ia64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.32) [ia64]

• dep: libelk0

  implementation of Scheme (the Extension Language Kit)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libpopt0 (>= 1.14)

  lib for parsing cmdline parameters

• dep: libprotobuf17 [ia64]

  protocol buffers C++ library

• dep: libprotobuf23 (>= 3.12.4) [не ia64]

  protocol buffers C++ library

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  compression library - runtime

Изтегляне на anfo

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	113,7 кБ	446,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	113,9 кБ	439,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	105,0 кБ	395,0 кБ	[списък на файловете]
armel	100,0 кБ	345,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	101,9 кБ	305,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	115,0 кБ	387,0 кБ	[списък на файловете]
i386	119,5 кБ	413,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	135,6 кБ	620,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	113,7 кБ	405,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	109,6 кБ	438,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	115,0 кБ	619,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	114,9 кБ	619,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64 (неофициална архитектура)	109,9 кБ	361,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	104,1 кБ	411,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	125,5 кБ	383,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	100,0 кБ	418,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	113,9 кБ	389,0 кБ	[списък на файловете]