Pacote: anfo (0.98-8)

[ Fonte: anfo  ]

Short Read Aligner/Mapper from MPG

Anfo is a mapper in the spirit of Soap/Maq/Bowtie, but its implementation takes more after BLAST/BLAT. It's most useful for the alignment of sequencing reads where the DNA sequence is somehow modified (think ancient DNA or bisulphite treatment) and/or there is more divergence between sample and reference than what fast mappers will handle gracefully (say the reference genome is missing and a related species is used instead).

Outros pacotes relacionados a anfo

• dep: libanfo0 (>= 0.98)

  Library for Short Read Aligner/Mapper from MPG

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libelk0

  implementação do Scheme (O kit de linguagem de extensão)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [não armel, armhf, i386, mipsel]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libpopt0 (>= 1.14)

  Biblioteca para analisar parâmetros de linha de comando.

• dep: libprotobuf23 (>= 3.12.3)

  protocol buffers C++ library

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

Download de anfo

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	113.9 kB	439.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	105.2 kB	395.0 kB	[lista de arquivos]
armel	99.8 kB	345.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	102.0 kB	305.0 kB	[lista de arquivos]
i386	119.6 kB	417.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	109.5 kB	438.0 kB	[lista de arquivos]
mipsel	110.5 kB	411.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	114.8 kB	619.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	104.0 kB	411.0 kB	[lista de arquivos]