Pacote: anfo (0.98-7)

[ Fonte: anfo  ]

Short Read Aligner/Mapper from MPG

Anfo is a mapper in the spirit of Soap/Maq/Bowtie, but its implementation takes more after BLAST/BLAT. It's most useful for the alignment of sequencing reads where the DNA sequence is somehow modified (think ancient DNA or bisulphite treatment) and/or there is more divergence between sample and reference than what fast mappers will handle gracefully (say the reference genome is missing and a related species is used instead).

Outros pacotes relacionados a anfo

• dep: libanfo0

  Library for Short Read Aligner/Mapper from MPG

• dep: libbz2-1.0

  bib. de alta qualid. de compactação de arqs. bas. em ordenação de blocos - exec

• dep: libc6 (>= 2.27)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libelk0

  implementação do Scheme (O kit de linguagem de extensão)

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, arm64]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]

• dep: libpopt0 (>= 1.14)

  Biblioteca para analisar parâmetros de linha de comando.

• dep: libprotobuf17

  protocol buffers C++ library

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

Download de anfo

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	115.6 kB	450.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	107.7 kB	410.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	104.5 kB	308.0 kB	[lista de arquivos]
i386	122.0 kB	428.0 kB	[lista de arquivos]