Paketti: anfo (0.98-9)

[ Source: anfo  ]

Short Read Aligner/Mapper from MPG

Anfo is a mapper in the spirit of Soap/Maq/Bowtie, but its implementation takes more after BLAST/BLAT. It's most useful for the alignment of sequencing reads where the DNA sequence is somehow modified (think ancient DNA or bisulphite treatment) and/or there is more divergence between sample and reference than what fast mappers will handle gracefully (say the reference genome is missing and a related species is used instead).

Muut pakettiin anfo liittyvät paketit

• dep: libanfo0 (>= 0.98)

  Library for Short Read Aligner/Mapper from MPG

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [ei alpha, ia64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.32) [ia64]

• dep: libelk0

  implementation of Scheme (the Extension Language Kit)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libpopt0 (>= 1.14)

  kirjasto komentoriviparametrien jäsentämiseen

• dep: libprotobuf17 [ia64]

  protocol buffers C++ library

• dep: libprotobuf23 (>= 3.12.4) [ei ia64]

  protocol buffers C++ library

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi anfo

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	113.7 kt	446.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	113.9 kt	439.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	105.0 kt	395.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	100.0 kt	345.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	101.9 kt	305.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	115.0 kt	387.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	119.5 kt	413.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	135.6 kt	620.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	113.7 kt	405.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	109.6 kt	438.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	115.0 kt	619.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	114.9 kt	619.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64 (epävirallinen siirros)	109.9 kt	361.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	104.1 kt	411.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	125.5 kt	383.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	100.0 kt	418.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	113.9 kt	389.0 kt	[tiedostoluettelo]