Paket: anfo (0.98-9)

[ Kaynak: anfo  ]

Short Read Aligner/Mapper from MPG

Anfo is a mapper in the spirit of Soap/Maq/Bowtie, but its implementation takes more after BLAST/BLAT. It's most useful for the alignment of sequencing reads where the DNA sequence is somehow modified (think ancient DNA or bisulphite treatment) and/or there is more divergence between sample and reference than what fast mappers will handle gracefully (say the reference genome is missing and a related species is used instead).

anfo ile İlgili Diğer Paketler

• dep: libanfo0 (>= 0.98)

  Library for Short Read Aligner/Mapper from MPG

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [alpha, ia64, riscv64, sh4 değil]

  dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.32) [ia64]

• dep: libelk0

  implementation of Scheme (the Extension Language Kit)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libpopt0 (>= 1.14)

  lib for parsing cmdline parameters

• dep: libprotobuf17 [ia64]

  protocol buffers C++ library

• dep: libprotobuf23 (>= 3.12.4) [ia64 değil]

  protocol buffers C++ library

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  compression library - runtime

anfo indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	113,7 kB	446,0 kB	[dosya listesi]
amd64	113,9 kB	439,0 kB	[dosya listesi]
arm64	105,0 kB	395,0 kB	[dosya listesi]
armel	100,0 kB	345,0 kB	[dosya listesi]
armhf	101,9 kB	305,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	115,0 kB	387,0 kB	[dosya listesi]
i386	119,5 kB	413,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	135,6 kB	620,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	113,7 kB	405,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	109,6 kB	438,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	115,0 kB	619,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	114,9 kB	619,0 kB	[dosya listesi]
riscv64 (resmi olmayan port)	109,9 kB	361,0 kB	[dosya listesi]
s390x	104,1 kB	411,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	125,5 kB	383,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	100,0 kB	418,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	113,9 kB	389,0 kB	[dosya listesi]