Pacote: minia (3.2.1+git20200522.4960a99-1)

[ Fonte: minia  ]

short-read biological sequence assembler

Short-read DNA sequence assembler based on a de Bruijn graph, capable of assembling a human genome on a desktop computer in a day.

The output of Minia is a set of contigs. Minia produces results of similar contiguity and accuracy to other de Bruijn assemblers (e.g. Velvet).

Outros pacotes relacionados a minia

• dep: bc

  linguagem de calculadora de precisão arbitrária bc do GNU

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [i386, mips64el, s390x]

• dep: libgatbcore3 (>= 1.4.1+git20191130.664696c+dfsg) [amd64]

  dynamic library of the Genome Analysis Toolbox

  dep: libgatbcore3 (>= 1.4.2+dfsg) [não amd64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [não i386]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libhdf5-103-1

  HDF5 C runtime files - serial version

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: zlib1g

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

• rec: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

• sug: bandage

  Bioinformatics Application for Navigating De novo Assembly Graphs Easily

Download de minia

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	388.9 kB	740.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	381.8 kB	728.0 kB	[lista de arquivos]
i386	397.0 kB	742.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	379.7 kB	779.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	389.6 kB	824.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	381.8 kB	752.0 kB	[lista de arquivos]