[ ソース: minia ]
パッケージ: minia (3.2.1+git20200522.4960a99-1)
minia に関するリンク
Debian の資源:
minia ソースパッケージをダウンロード:
- [minia_3.2.1+git20200522.4960a99-1.dsc]
- [minia_3.2.1+git20200522.4960a99.orig.tar.xz]
- [minia_3.2.1+git20200522.4960a99-1.debian.tar.xz]
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [minia.genouest.org]
類似のパッケージ:
short-read biological sequence assembler
Short-read DNA sequence assembler based on a de Bruijn graph, capable of assembling a human genome on a desktop computer in a day.
The output of Minia is a set of contigs. Minia produces results of similar contiguity and accuracy to other de Bruijn assemblers (e.g. Velvet).
その他の minia 関連パッケージ
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- dep: bc
- GNU bc: 任意精度の計算言語
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.4) [i386, mips64el, s390x]
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- dep: libgatbcore3 (>= 1.4.1+git20191130.664696c+dfsg) [amd64]
- dynamic library of the Genome Analysis Toolbox
- dep: libgatbcore3 (>= 1.4.2+dfsg) [amd64 以外]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [i386 以外]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
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- dep: libhdf5-103-1
- HDF5 C runtime files - serial version
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- dep: libstdc++6 (>= 9)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: zlib1g
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
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- rec: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
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- sug: bandage
- Bioinformatics Application for Navigating De novo Assembly Graphs Easily