Pakiet: minia (3.2.1+git20200522.4960a99-1)

[ Pakiet źródłowy: minia  ]

short-read biological sequence assembler

Short-read DNA sequence assembler based on a de Bruijn graph, capable of assembling a human genome on a desktop computer in a day.

The output of Minia is a set of contigs. Minia produces results of similar contiguity and accuracy to other de Bruijn assemblers (e.g. Velvet).

Inne pakiety związane z minia

• dep: bc

  GNU bc - język kalkulatora z dowolną precyzją

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [i386, mips64el, s390x]

• dep: libgatbcore3 (>= 1.4.1+git20191130.664696c+dfsg) [amd64]

  dynamic library of the Genome Analysis Toolbox

  dep: libgatbcore3 (>= 1.4.2+dfsg) [nie amd64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie i386]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libhdf5-103-1

  HDF5 C runtime files - serial version

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: zlib1g

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

• rec: samtools

  Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

• sug: bandage

  Bioinformatics Application for Navigating De novo Assembly Graphs Easily

Pobieranie minia

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	388,9 KiB	740,0 KiB	[lista plików]
arm64	381,8 KiB	728,0 KiB	[lista plików]
i386	397,0 KiB	742,0 KiB	[lista plików]
mips64el	379,7 KiB	779,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	389,6 KiB	824,0 KiB	[lista plików]
s390x	381,8 KiB	752,0 KiB	[lista plików]