Paket: minia (3.2.1+git20200522.4960a99-1)

[ Quellcode: minia  ]

short-read biological sequence assembler

Short-read DNA sequence assembler based on a de Bruijn graph, capable of assembling a human genome on a desktop computer in a day.

The output of Minia is a set of contigs. Minia produces results of similar contiguity and accuracy to other de Bruijn assemblers (e.g. Velvet).

Andere Pakete mit Bezug zu minia

• dep: bc

  GNU bc - Rechnersprache mit beliebiger Genauigkeit

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [i386, mips64el, s390x]

• dep: libgatbcore3 (>= 1.4.1+git20191130.664696c+dfsg) [amd64]

  dynamic library of the Genome Analysis Toolbox

  dep: libgatbcore3 (>= 1.4.2+dfsg) [nicht amd64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht i386]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libhdf5-103-1

  Hierarchisches Datenformat 5 (HDF5) - C-Laufzeitdateien - serielle Version

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: zlib1g

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

• rec: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

• sug: bandage

  Bioinformatics Application for Navigating De novo Assembly Graphs Easily

minia herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	388,9 kB	740,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	381,8 kB	728,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	397,0 kB	742,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	379,7 kB	779,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	389,6 kB	824,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	381,8 kB	752,0 kB	[Liste der Dateien]