Пакунок: minia (3.2.1+git20200522.4960a99-1)

[ Source: minia  ]

short-read biological sequence assembler

Short-read DNA sequence assembler based on a de Bruijn graph, capable of assembling a human genome on a desktop computer in a day.

The output of Minia is a set of contigs. Minia produces results of similar contiguity and accuracy to other de Bruijn assemblers (e.g. Velvet).

Інші пакунки пов'язані з minia

• dep: bc

  Алгебраїчна мова GNU bc з довільною точністю обчислень

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [i386, mips64el, s390x]

• dep: libgatbcore3 (>= 1.4.1+git20191130.664696c+dfsg) [amd64]

  dynamic library of the Genome Analysis Toolbox

  dep: libgatbcore3 (>= 1.4.2+dfsg) [not amd64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not i386]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libhdf5-103-1

  HDF5 C runtime files - serial version

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: zlib1g

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

• rec: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

• sug: bandage

  Bioinformatics Application for Navigating De novo Assembly Graphs Easily

Завантажити minia

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	388.9 kB	740.0 kB	[список файлів]
arm64	381.8 kB	728.0 kB	[список файлів]
i386	397.0 kB	742.0 kB	[список файлів]
mips64el	379.7 kB	779.0 kB	[список файлів]
ppc64el	389.6 kB	824.0 kB	[список файлів]
s390x	381.8 kB	752.0 kB	[список файлів]