Package: boxshade (3.3.1-14)

[ Source: boxshade  ]

embelezador de impressão de alinhamentos de seqüência múltipla

Boxshade é um programa para criar saídas de impressão de boa aparência a partir de seqüências de proteínas múltiplas alinhadas ou DNA. O programa não executa o alinhamento sozinho e requer como entrada um arquivo que tenha sido criado por um programa de alinhamento múltiplo ou editado manualmente com as respectivas ferramentas.

Boxshade lê seqüências múltiplas alinhadas a partir de arquivos PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data e ESEE-save (limitado a um máximo de 150 seqüências com até 10000 elementos cada). Vários tipos de sombreados podem ser aplicados a resíduos idênticos/similares. A saída é escrita na tela ou em um arquivo nos seguintes formatos: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, use::typesetting, Supports Format: works-with-format::html, works-with-format::plaintext, works-with-format::postscript, works-with-format::tex, Works with: Need an extra tag, Text

Other Packages Related to boxshade

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.7) [not amd64, arm64, ppc64el]

• sug: kalign

  Global and progressive multiple sequence alignment

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  perfis "hidden Markov models" para análise de seqüência de proteína

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• sug: texlive-latex-extra

  TeX Live: LaTeX additional packages

• sug: xfig

  Ferramenta para Geração Interativa de figuras no X11

Download boxshade

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	54.5 kB	161.0 kB	[list of files]
arm64	53.1 kB	160.0 kB	[list of files]
armel	54.6 kB	163.0 kB	[list of files]
armhf	52.9 kB	135.0 kB	[list of files]
i386	56.0 kB	176.0 kB	[list of files]
mips64el	53.3 kB	187.0 kB	[list of files]
mipsel	52.9 kB	173.0 kB	[list of files]
ppc64el	56.4 kB	193.0 kB	[list of files]
s390x	52.9 kB	168.0 kB	[list of files]