Pakiet: anfo (0.98-8)

[ Pakiet źródłowy: anfo  ]

Short Read Aligner/Mapper from MPG

Anfo is a mapper in the spirit of Soap/Maq/Bowtie, but its implementation takes more after BLAST/BLAT. It's most useful for the alignment of sequencing reads where the DNA sequence is somehow modified (think ancient DNA or bisulphite treatment) and/or there is more divergence between sample and reference than what fast mappers will handle gracefully (say the reference genome is missing and a related species is used instead).

Inne pakiety związane z anfo

• dep: libanfo0 (>= 0.98)

  Library for Short Read Aligner/Mapper from MPG

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libelk0

  implementation of Scheme (the Extension Language Kit)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, i386, mipsel]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libpopt0 (>= 1.14)

  Biblioteka parsera parametrów linii komend

• dep: libprotobuf23 (>= 3.12.3)

  protocol buffers C++ library

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie anfo

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	113,9 KiB	439,0 KiB	[lista plików]
arm64	105,2 KiB	395,0 KiB	[lista plików]
armel	99,8 KiB	345,0 KiB	[lista plików]
armhf	102,0 KiB	305,0 KiB	[lista plików]
i386	119,6 KiB	417,0 KiB	[lista plików]
mips64el	109,5 KiB	438,0 KiB	[lista plików]
mipsel	110,5 KiB	411,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	114,8 KiB	619,0 KiB	[lista plików]
s390x	104,0 KiB	411,0 KiB	[lista plików]