Package: anfo (0.98-8)

[ Source: anfo  ]

strumento per allineare/mappare letture corte da MPG

Anfo è uno strumento per mappatura nello spirito di Soap/Maq/Bowtie, ma la sua implementazione assomiglia più a BLAST/BLAT. È utile soprattutto per l'allineamento di letture di sequenze in cui la sequenza di DNA è in qualche modo modificata (si pensi a DNA ancestrale o a trattamento con bisolfito) o c'è più divergenza tra il campione e il riferimento di quanta viene gestita bene dai mappatori veloci (ad esempio il genoma di riferimento è mancante e viene usata invece una specie correlata).

Other Packages Related to anfo

• dep: libanfo0 (>= 0.98)

  libreria per strumento per allineare/mappare letture corte da MPG

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libelk0

  implementazione di Scheme (Extension Language Kit)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, i386, mipsel]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libpopt0 (>= 1.14)

  libreria per l'analisi dei parametri della riga di comando

• dep: libprotobuf23 (>= 3.12.3)

  libreria C++ per Protocol Buffers

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

Download anfo

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	113.9 kB	439.0 kB	[list of files]
arm64	105.2 kB	395.0 kB	[list of files]
armel	99.8 kB	345.0 kB	[list of files]
armhf	102.0 kB	305.0 kB	[list of files]
i386	119.6 kB	417.0 kB	[list of files]
mips64el	109.5 kB	438.0 kB	[list of files]
mipsel	110.5 kB	411.0 kB	[list of files]
ppc64el	114.8 kB	619.0 kB	[list of files]
s390x	104.0 kB	411.0 kB	[list of files]