Pacote: ampliconnoise (1.29-9)

[ Fonte: ampliconnoise  ]

remoção de ruído de amplicons PCR sequenciados em 454

AmpliconNoise é um pacote de aplicações para arrumar sequências de dados de alto rendimento. Consiste em três principais partes:

Pyronoise - realiza clustering baseado em fluxograma para encontrar leituras incorretas SeqNoise - remove mutações de pontos PCR Perseus - remove quimeras PCR sem a necessidade de um conjunto de sequências de referência

Anteriormente, havia um "Pyronoise" independente dos(as) mesmos(as) autores(as) e este pacote inclui uma versão atualizada. Também existe um "Denoiser" no Qiime, que é relacionado, mas distinto.

Etiquetas: Função: Programa

Outros pacotes relacionados a ampliconnoise

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libgsl25 (>= 2.6)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libopenmpi3 (>= 4.0.4)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: mafft

  Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

• rec: openmpi-bin

  biblioteca de passagem de mensagens de alto desempenho -- binários

Download de ampliconnoise

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	1,080.6 kB	2,036.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1,073.3 kB	1,960.0 kB	[lista de arquivos]
armel	1,065.4 kB	1,955.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	1,061.2 kB	1,819.0 kB	[lista de arquivos]
i386	1,078.5 kB	2,011.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	1,073.7 kB	2,022.0 kB	[lista de arquivos]
mipsel	1,070.4 kB	1,973.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1,093.8 kB	2,592.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	1,073.6 kB	2,012.0 kB	[lista de arquivos]