Pacote: ampliconnoise (1.29-8)

[ Fonte: ampliconnoise  ]

remoção de ruído de amplicons PCR sequenciados em 454

AmpliconNoise é um pacote de aplicações para arrumar sequências de dados de alto rendimento. Consiste em três principais partes:

Pyronoise - realiza clustering baseado em fluxograma para encontrar leituras incorretas SeqNoise - remove mutações de pontos PCR Perseus - remove quimeras PCR sem a necessidade de um conjunto de sequências de referência

Anteriormente, havia um "Pyronoise" independente dos(as) mesmos(as) autores(as) e este pacote inclui uma versão atualizada. Também existe um "Denoiser" no Qiime, que é relacionado, mas distinto.

Etiquetas: Função: Programa

Outros pacotes relacionados a ampliconnoise

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]

• dep: libgsl23 (>= 2.5)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgslcblas0 (>= 2.4)

  GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package

• dep: libopenmpi3

  high performance message passing library -- shared library

• dep: mafft

  Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

• rec: openmpi-bin

  biblioteca de passagem de mensagens de alto desempenho -- binários

Download de ampliconnoise

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	464.6 kB	1,427.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	456.5 kB	1,365.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	446.3 kB	1,214.0 kB	[lista de arquivos]
i386	463.8 kB	1,402.0 kB	[lista de arquivos]