Package: velvet (1.2.10+dfsg1-8)

[ Source: velvet  ]

assemblatore di sequenze di acidi nucleici da sequenze molto corte

Velvet è un assemblatore genomico de novo progettato specificatamente per le tecnologie di sequenziamento basate su sequenze corte, come Solexa o 454, sviluppato da Daniel Zerbino e Ewan Birney all'European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), vicino a Cambridge, in Gran Bretagna.

Velvet attualmente accetta sequenze molto corte, rimuove errori e poi produce frammenti contigui unici di alta qualità. Poi usa informazioni sulle paired-read, se disponibili, per recuperare le aree ripetute tra i vari frammenti contigui.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Purpose: Analysing

Other Packages Related to velvet

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

  libreria di compressione - runtime

• sug: velvet-example

  dati di esempio per l'assemblatore di sequenze Velvet

Download velvet

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	658.0 kB	1,256.0 kB	[list of files]
arm64	637.2 kB	1,333.0 kB	[list of files]
armel	655.1 kB	1,459.0 kB	[list of files]
armhf	638.3 kB	1,075.0 kB	[list of files]
i386	685.9 kB	1,453.0 kB	[list of files]
mips64el	654.7 kB	1,511.0 kB	[list of files]
mipsel	675.5 kB	1,632.0 kB	[list of files]
ppc64el	667.2 kB	1,589.0 kB	[list of files]
s390x	642.5 kB	1,301.0 kB	[list of files]