Package: probalign (1.4-10)

[ Source: probalign  ]

Multiple sekvensjustering med brug partitionsfunktionel posteriore sandsynligheder

Probalign bruger estimater, fra partitionsfunktionelle posteriore sandsynligheder, til at beregne den maksimale præcision for multiple sekvensjusteringer. Den yder statistisk set betydeligt bedre end de ledende justeringsprogrammer Probcons v1.1, MAFFT v5.851 og MUSCLE v3.6 i ydelsesmålinger fra BAliBASE 3.0, HOMSTRAD og OXBENCH. Forbedringerne med Probalign er størst på datasæt, der indeholder udvidelser til N/C- terminalen, og på datasæt med sekvenser som er lange sekvenser og har heterogene længder. Med datasæt bestående af heterogene længder, der indeholder gentagelser, er præcisionen for Probalign 10 % og 15 % højere end de andre tre metoder, når standardafvigelse på længden er mindst 300 og 400.

Other Packages Related to probalign

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, ppc64el]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

Download probalign

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	68.9 kB	175.0 kB	[list of files]
arm64	64.6 kB	219.0 kB	[list of files]
armel	55.1 kB	142.0 kB	[list of files]
armhf	53.9 kB	114.0 kB	[list of files]
i386	61.4 kB	158.0 kB	[list of files]
mips64el	65.4 kB	223.0 kB	[list of files]
mipsel	64.2 kB	221.0 kB	[list of files]
ppc64el	78.4 kB	219.0 kB	[list of files]
s390x	56.7 kB	171.0 kB	[list of files]