Paket: probalign (1.4-10)

[ Källkod: probalign  ]

multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities

Probalign uses partition function posterior probability estimates to compute maximum expected accuracy multiple sequence alignments. It performs statistically significantly better than the leading alignment programs Probcons v1.1, MAFFT v5.851, and MUSCLE v3.6 on BAliBASE 3.0, HOMSTRAD, and OXBENCH benchmarks. Probalign improvements are largest on datasets containing N/C terminal extensions and on datasets with long and heterogeneous length sequences. On heteregeneous length datasets containing repeats Probalign alignment accuracy is 10% and 15% higher than the other three methods when standard deviation of length is at least 300 and 400.

Andra paket besläktade med probalign

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf, ppc64el]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

Hämta probalign

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	68,9 kbyte	175,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	64,6 kbyte	219,0 kbyte	[filförteckning]
armel	55,1 kbyte	142,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	53,9 kbyte	114,0 kbyte	[filförteckning]
i386	61,4 kbyte	158,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	65,4 kbyte	223,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	64,2 kbyte	221,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	78,4 kbyte	219,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	56,7 kbyte	171,0 kbyte	[filförteckning]